《表1 所用引物序列信息:小西葫芦黄花叶病毒山东南瓜和丝瓜分离物全基因组序列分析》
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《小西葫芦黄花叶病毒山东南瓜和丝瓜分离物全基因组序列分析》
注:*表示用于5′RACE扩增5′末端序列所需要的引物,其序列参考Scotto-Lavino等(2006)的报道。
根据NCBI数据库中ZYMV CP基因的保守序列设计特异性引物(表1)。分别取有明显病毒病症状的南瓜和丝瓜叶片0.1 g,放入预冷的研钵,在液氮中研磨至粉状后转移至灭菌的2.0 m L离心管。利用TransZol法提取植物总RNA。以Oligo(dT)18和随机引物(5′-NNNNNN-3′)对获得的总RNA进行反转录合成cDNA。在0.2 mL离心管中分别加入提取的植物总RNA 5.0μL、Oligo(dT)18和随机引物各1.0μL、ddH2O 5.0μL,置于70℃孵育10 min后迅速转移至冰上放置2 min以上。在上述反应液中加入5×反转录缓冲液4.0μL、10 mmol·L-1 dNTPs 1.0μL、反转录酶M-MLV(200 U·μL-1)0.5μL、RNA酶抑制剂(RRI)1.0μL后30℃孵育10 min、42℃1 h、70℃15 min,反应结束后将获得的cDNA置于–20℃保存。以获得的cDNA为模板,利用ZYMV特异性引物ZYMV-CP-F8540/ZYMV-CP-R9324进行PCR扩增,退火温度参照表1。利用1.0%琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增结果。
图表编号 | XD0046662400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.25 |
作者 | 王健、冀树娴、王莹、耿超、李向东、田延平 |
绘制单位 | 山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室、山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室、临沂大学、山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室、山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室、山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室 |
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