《表2 ZYMV分离物序列信息》
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《小西葫芦黄花叶病毒山东南瓜和丝瓜分离物全基因组序列分析》
注:分离物名称前两个字符表明国家代码,第2部分为数据库中相应的分离物名称,第3部分为采集年份(如果无相关信息,则不写)。
选取NCBI数据库中(截止到2018年6月30日)含有ZYMV多聚蛋白编码区序列的分离物的基因组序列(剔除含有不确定核苷酸N以及存在终止密码子的分离物)(表2) 。根据马铃薯Y病毒属病毒自身编码的蛋白酶所识别的保守位点(Adams et al.,2015),明确ZYMV分离物中各个病毒蛋白的起止位置。利用Bio-edit软件中的Clustal X程序分析本研究中ZYMV分离物与数据库中已有分离物在核苷酸和氨基酸水平上的序列一致率。
图表编号 | XD0046662500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.25 |
作者 | 王健、冀树娴、王莹、耿超、李向东、田延平 |
绘制单位 | 山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室、山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室、临沂大学、山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室、山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室、山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室 |
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