《表2 Sch VX贵州分离物相关contig与参考基因组序列比对》

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《侵染贵州火龙果的仙人指X病毒的基因组序列变异》


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参试样品中的SchVX相关contig序列与参考基因组SchVX-Palma-PE(Genbank登录号:KP090203)进行序列比对和一致性计算的结果(表2)显示,6份样品中,contig长度最短为201 bp,最长为5 617 bp。每份样品中的contig序列均覆盖99.2%~99.6%的参考基因组,说明6份样品获得的SchVX相关contig序列基本覆盖完整的参考基因组。ZYP样品中的contig序列与参考基因组序列的一致性为82.8%~100.0%,其他5份样品的序列一致性为85.9%~96.7%。