《表1 火龙果样品的Sch VX相关clean read和contig序列》

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《侵染贵州火龙果的仙人指X病毒的基因组序列变异》

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注:占比指占该样品中所有clean read数量的百分比。

对6份样品获得的clean read分别进行组装，获得大量contig序列。通过在NCBI中进行BLASTn和BLASTx检索，筛选出SchVX相关的contig序列结果（表1），6份样品中SchVX相关contig数量为18～52条。样品LR中SchVX相关的clean read数量最少，仅3 269条，占该样品中所有clean read数量的0.003%。其余5份样品中，SchVX相关clean read数量为3 540 797～17 792 691条。样品LW中SchVX相关的clean read数量最多，达17 792 691条，占该样品中所有clean read数量的17.5%。