《表1 各样品reads数及OTUs数》

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《施用不同肥料对烟草土壤细菌群落的影响》


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注:CK:移摘前土壤;T1:常规施肥;T2:腐殖酸型有机无机复混肥;T3:腐殖酸型生物有机肥;T4:-N20%腐殖酸型生物有机肥。R:团棵期;P:采收期。下同。

由表1可知,通过对细菌16s rDNA的V3~V4区进行测序过滤,9个样品获得有效序列数在48889~57879,OTUs数在4392~5277,在97%相似水平下聚类为用于物种分类的OTU,统计得到各个样品在不同OTU中的丰度信息。标准化后的序列数大于10000条,说明测序效果很好,满足后续基因多样性及丰度等功能分析。