《表1 毛华菊CRY2基因分离及表达分析时所用的引物序列信息》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《毛华菊CvCRY2基因的克隆、生物信息学及表达分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

利用DNAMAN 7.0软件进行序列拼接以获得各基因的cDNA全长。为保证拼接得到的c DNA全长的正确性，在序列5'UTR和3'UTR处设计特异性引物（表1），以扩增各基因的cDNA全长序列。将测序结果与NCBI数据库中的同源序列及现有的毛华菊转录组中获得的CRY2序列进行比对，并对毛华菊CvCRY2蛋白结构域进行预测。利用Protparam在线软件计算氨基酸理化性质，各项指标包括:氨基酸数目、分子量、理论等电点、分子式和不稳度指数；利用SMART在线软件对CvCRY2蛋白氨基酸序列进行功能域预测和分析；在NCBI数据库中查找不同物种中CvCRY2基因的同源序列，利用MEGA5.0软件邻接算法，自检举1 000次，构建系统进化树；通过在线Proscale分析并预测蛋白亲/疏水性；利用SOPMA对CvCRY2蛋白二级结构进行预测。