《表4 荷斯坦奶牛与其他10个物种FGFR2基因序列相似性比对》

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《荷斯坦奶牛FGFR2基因组织表达及生物信息学分析》

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利用Meg Align软件将克隆得到的荷斯坦奶牛FGFR2基因序列与家猫、黄牛、家鸡、猕猴、黑猩猩、野猪、家犬、绵羊、热带爪蟾、苏门答腊猩猩基因序列作相似性比对，其中荷斯坦奶牛与黄牛序列相似性高达100%，与热带爪蟾相似性最低为67.2%（见表4）。基于Tamura-Nei模型最大似然法推导进化树模型，选择具有最高对数可行性的树（-6 150.52），将Neighbor-Join和Bio NJ算法应用于最大复合似然（MCL）方法估计成对距离矩阵，选择具有优越对数似然值拓扑，最后获得用于启发式搜索的初始树。分析涉及10个核苷酸序列，所有包含空白和缺失数据的位置均删除，所有进化分析在MEGA7.0中完成，结果显示荷斯坦奶牛与黄牛亲缘性最近，其次为野猪；而与热带爪蟾较低等脊椎动物相距最远（见图9）。