《表3 13个潜在新物种的16S r RNA基因序列Ez Bio Could比对结果TTaabbllee 33 EEzz BBiioo CCoouulldd BBLLAASSTT rreessuull
注:括号中数字表示潜在新物种与其16S r RNA基因序列最相近菌株序列比对的差异碱基数目与碱基总数Note:numbers in brackets represent the different number and total number of bases of potential new species compared with themost related strains based on the 16S r RN
以98%作为区分两个原核物种的“金标准”[14],即菌株16S r RNA基因序列最大相似度低于98%的视为潜在新物种,同时合并相互之间的16S r RNA基因全序列相似度大于98%的菌株为同一物种,合并后本研究发现与已知最相似菌种的最高相似性范围在95.45%~97.99%之间的有13个(16S r RNA基因序列Ez Bio Could比对结果见表3),分别隶属于厚壁菌门的芽胞杆菌属、显核菌属、假芽胞杆菌属、类芽胞杆菌属和类芽胞八叠球菌属。本研究未发现放线菌门和拟杆菌门类群的潜在新物种,在后续研究中应调整分离培养基的选择性,拓展对海洋放线菌稀有资源的发现。
图表编号 | XD00186293900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.08.30 |
作者 | 陈柔雯、王可欣、何媛秋、田新朋、龙丽娟 |
绘制单位 | 中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省海洋药物重点实验室中国科学院海洋微生物研究中心、中国科学院大学、中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省海洋药物重点实验室中国科学院海洋微生物研究中心、中国科学院大学、中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省海洋药物重点实验室中国科学院海洋微生物研究中心、中国科学院大学、中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省海洋药物重点实验室中国科学院海 |
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