《表3 13个潜在新物种的16S r RNA基因序列Ez Bio Could比对结果TTaabbllee 33 EEzz BBiioo CCoouulldd BBLLAASSTT rreessuull

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《一份南海深海沉积物样品中可培养细菌的多样性》


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注:括号中数字表示潜在新物种与其16S r RNA基因序列最相近菌株序列比对的差异碱基数目与碱基总数Note:numbers in brackets represent the different number and total number of bases of potential new species compared with themost related strains based on the 16S r RN

以98%作为区分两个原核物种的“金标准”[14],即菌株16S r RNA基因序列最大相似度低于98%的视为潜在新物种,同时合并相互之间的16S r RNA基因全序列相似度大于98%的菌株为同一物种,合并后本研究发现与已知最相似菌种的最高相似性范围在95.45%~97.99%之间的有13个(16S r RNA基因序列Ez Bio Could比对结果见表3),分别隶属于厚壁菌门的芽胞杆菌属、显核菌属、假芽胞杆菌属、类芽胞杆菌属和类芽胞八叠球菌属。本研究未发现放线菌门和拟杆菌门类群的潜在新物种,在后续研究中应调整分离培养基的选择性,拓展对海洋放线菌稀有资源的发现。