《表8 沿全基因组采用不同密度的SNP数量进行IS分析的结果》
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《基因组学方法用于水稻种质资源实质派生的检测结果和应用讨论》
为了获得和验证到底需要使用多少SNP,才能以尽可能低的成本获得可靠的水稻品种间相似度比较结果.本团队也利用在基因组均匀分布的不同密度的SNP数量进行IS分析的比较.本团队将全基因组分别用100,500,1000,10000,800000个SNP进行IS分析(当然不是在每条染色体上都能找到理想的SNP绝对平均分布以达到上述密度分布的要求,只是尽量靠近即可).结果见表8,随着标记的增加,样品之间的差异程度更接近于全基因组水平差异程度评估的结果.
图表编号 | XD00162074600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.20 |
作者 | 张上都、袁定阳、路洪凤、简燕、李秀欣、黄安平、罗正良、吕启明、谭炎宁、张勇飞、袁隆平、柏连阳 |
绘制单位 | 湖南省农业科学院、中南大学研究生院隆平分院、贵州省农业科学院水稻研究所、湖南省农业科学院、北京诺禾致源科技股份有限公司、湖南省农业科学院、北京诺禾致源科技股份有限公司、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、中南大学研究生院隆平分院 |
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