《表9 两个不育系的EDV进行全基因组的SSR模拟运行结果》
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《基因组学方法用于水稻种质资源实质派生的检测结果和应用讨论》
nil指没有SSR扩增产物
本研究表明,应用动物群体遗传学和基因组学开发的相同起源基因鉴定的IS方法,其精确度和广度上都比现行的部颁标准使用的24对SSR分子标记比对法,在定性、定量和基因组覆盖度等方面要显著优越.通过表9的数据可以发现如下事实:(ⅰ)SSR标记的电泳图谱远远不能清楚反映全部的PCR产物标记所表现的差异,基于SSR标记的国标只能捕捉不到1/3的差异,而且只能反映PCR产物趋于富集的扩增产物;(ⅱ)在目前重测序价格已经降低到了近40元/1 G的推广成本之后,水稻品种的真实性和相似度检测已经可以快速升级,用基于重测序的基因组学手段进行10层以上重测序,并且可以将成本降低到300元/1个样品.上述两点思考都建议品种审定的管理部门,重新审议是否应该继续保留使用NYT 1433-2014的SSR为基准的国家行业标准.
图表编号 | XD00162074500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.20 |
作者 | 张上都、袁定阳、路洪凤、简燕、李秀欣、黄安平、罗正良、吕启明、谭炎宁、张勇飞、袁隆平、柏连阳 |
绘制单位 | 湖南省农业科学院、中南大学研究生院隆平分院、贵州省农业科学院水稻研究所、湖南省农业科学院、北京诺禾致源科技股份有限公司、湖南省农业科学院、北京诺禾致源科技股份有限公司、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、中南大学研究生院隆平分院 |
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