《表3 可进行引物设计的特异基因SSR位点统计》
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《基于RNA-seq数据的栽培种花生SSR位点鉴定和标记开发》
根据序列注释信息,共有5 020条转录本序列对应到特定的基因,共包含5 859个可进行引物设计的SSR位点(单一位点和复合位点),基因的平均SSR位点密度为1.17(表3),共设计出17 574对特定基因SSR引物(每个位点设计3对引物)。与基因对应的SSR位点在A基因组和B基因组共20条染色体上不均匀分布(表3),其中B03染色体上SSR位点最多,为484个;单一位点范围为170(A02)—451(B03),共5 533个;复合位点范围为9(A01)—33(B03),共326个。这些包含SSR位点的基因主要以单位点基因的形式存在(68.75%),单条染色体基因数目为160(A07)—430(B03),其中单位点基因范围为110(A07)—328(B03),多位点基因范围为13(A02)—49(B04)。
图表编号 | XD00143874100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.16 |
作者 | 徐志军、赵胜、徐磊、胡小文、安东升、刘洋 |
绘制单位 | 中国热带农业科学院湛江实验站、广东省旱作节水农业工程技术研发中心、中国农业科学院农业基因组研究所、中国热带农业科学院湛江实验站、广东省旱作节水农业工程技术研发中心、中国热带农业科学院湛江实验站、广东省旱作节水农业工程技术研发中心、中国热带农业科学院湛江实验站、广东省旱作节水农业工程技术研发中心、中国热带农业科学院湛江实验站、广东省旱作节水农业工程技术研发中心 |
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