《表3 SSR扩增位点引物》
根据SSR位点两侧保守序列,共设计了14对SSR扩增引物(表3),其中CLSSR3位点无法设计引物。为了检测所设计的引物的有效性,以来源于不同地理种源的12个杉木无性系为材料,进行PCR扩增及等位位点多样性检测(图2),发现14对SSR引物皆能得到有效扩增;其中7对能够在这12个无性系间扩增出具多态性的产物,共检测到18个等位变异,每对引物组合可检测到2~4个等位变异,平均每对引物产生2.571 4个。这表明本次从杉木木材形成功能基因内检测到的SSR位点在所检测的不同基因型间具有较高的多样性。进一步对具多态性的PCR产物进行克隆测序,图3显示了杉木NAC(NAM,ATAF1/ATAF2,CUC2)转录因子基因1(ClNAC1)3'UTR的GATT为重复单元SSR位点的多样性。测序数据与毛细管电泳结果一致,表明本次实验开发的SSR引物有效,可用于杉木的分子遗传多样性分析。
图表编号 | XD0038769300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.25 |
作者 | 杭芸、俞金健、周世水、程健弘、黄华宏、林二培、童再康 |
绘制单位 | 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室、浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室、浙江省开化县林场、浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室、浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室、浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室、浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室 |
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