《表2 用于SSR检测的候选基因》
为了检测杉木木材形成相关基因内的SSR位点,选取参与杉木纤维素、木质素生物合成的10个候选基因作为目标,对这些基因的全长序列进行克隆(表2)。由表2可见,10个基因的长度为1 554~7 550 bp,共覆盖杉木基因组长度为34 653 bp。通过对这10个基因序列的搜寻,共检测到15个SSR位点。由图1可知,在这15个SSR位点中,6个来自基因的外显子区域,3个来自基因的内含子区域,3个来自基因的5'UTR,3个来自基因的3'UTR。这些SSR位点中的重复基元有二碱基、三碱基、四碱基和六碱基等形式,其中以三碱基重复的位点最多,占总数的46.7%;四碱基重复位点占40%,而二碱基、六碱基重复位点均只有1个。其中,处于基因编码区SSR位点的基元皆是三碱基,这可能与进化过程中编码区三联体密码子所受选择压有关。
图表编号 | XD0038769400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.25 |
作者 | 杭芸、俞金健、周世水、程健弘、黄华宏、林二培、童再康 |
绘制单位 | 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室、浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室、浙江省开化县林场、浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室、浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室、浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室、浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室 |
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