《表5 与光周期敏感性关联的SSR位点及候选基因Tab.5 The SSR loci and candidate genes associated with photoperiod sensitivi

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《谷子SSR标记与光周期敏感性的关联分析》

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关联分析结果表明，在P<0.05的显著水平下共检测到2个与光周期敏感性相关联的SSR标记，即b200和b127，分别位于谷子的7号染色体和5号染色体（表5）。用这2个标记的引物序列搜索谷子基因组数据库（https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html），发现这2个标记分别位于2个基因内部，其中b200位于登录号为Seita.7G284800的基因内部，该基因编码Myb类型的转录因子，根据基因组数据库提供的基因共表达信息，发现Myb转录因子与组蛋白及其修饰相关的基因存在共表达，如组蛋白H3基因（Seita.6G070000）、组蛋白-赖氨酸-氮-甲基转移酶基因EZH2（Seita.4G060900）、组蛋白-赖氨酸-氮-甲基转移酶基因SU（VAR）（Seita.3G095100） 。此外Myb转录因子还与生长素应答蛋白14（Seita.9G162900）存在共表达，因此，推断所关联的基因是通过表观遗传学修饰的方式以及生长素信号传导的方式调控谷子光周期途径开花。而b127位于登录号为Seita.5G224300的基因内部，该基因编码一个功能未注释的蛋白DUF1644，根据数据库提供的基因表达信息，发现该基因在蓝光和远红光诱导条件下高度表达，与许多光周期响应蛋白存在相似性，推测该基因受光周期调控，与谷子光周期敏感性存在一定关系。