《表1 栽培种花生RNA-seq SSR位点分布特征》

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《基于RNA-seq数据的栽培种花生SSR位点鉴定和标记开发》


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栽培种花生转录组重复单元类型丰富,单核苷酸到五核苷酸均存在,各重复单元组成的SSR数量上存在着较大差异(表1)。其中以单核苷酸和三核苷酸为重复单元的SSR位点数最多,分别占SSR位点总数的39.24%和38.40%,分布频率为14.37%和14.06%,其中以五核苷酸为重复单元的SSR位点数最少,仅为48个。在SSR位点基序种类方面,不同重复单元在基序种类上存在着丰富的多样性,单核苷酸到五核苷酸基序种类分别为4、12、60、87和39种,共202种,从单核苷酸到四核苷酸基序种类随着重复单元碱基数增加而增加(表1)。