《表2 栽培种花生SSR各重复单元重复次数及分布频率》
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《基于RNA-seq数据的栽培种花生SSR位点鉴定和标记开发》
鉴定的SSR位点各重复单元的重复次数和SSR位点长度存在着明显的差异(表2和图1)。重复单元的重复次数为5—47(单核苷酸)次,随着重复次数的增加,同一重复单元类型的SSR位点数逐渐减少。其中,单核苷酸重复次数主要集中在10—12次;二核苷酸重复次数主要集中在6—8次;三核苷酸重复次数主要集中在5—6次;四核苷酸和五核苷酸重复次数主要集中在5次。从整体上看,重复单元的重复次数主要集中在5、6和10次,在所有SSR位点中的分布频率分别为24.24%、18.87%和17.37%。单个SSR位点的长度的分布范围为10—47 bp,基序长度主要集中在10—14 bp,其中,长度为10和12 bp的基序数量最多,分别为2 985和2 389个;复合SSR位点的长度范围为21—249 bp,其中,以长度为31—40 bp的复合位点最多,随着基序长度增加,复合SSR位点数呈逐步减少的趋势。
图表编号 | XD00143874300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.16 |
作者 | 徐志军、赵胜、徐磊、胡小文、安东升、刘洋 |
绘制单位 | 中国热带农业科学院湛江实验站、广东省旱作节水农业工程技术研发中心、中国农业科学院农业基因组研究所、中国热带农业科学院湛江实验站、广东省旱作节水农业工程技术研发中心、中国热带农业科学院湛江实验站、广东省旱作节水农业工程技术研发中心、中国热带农业科学院湛江实验站、广东省旱作节水农业工程技术研发中心、中国热带农业科学院湛江实验站、广东省旱作节水农业工程技术研发中心 |
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