《表3 栽培种甘蔗、割手密与高粱同源基因在高粱基因组上的分布及SSR位点数》

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《基于甘蔗AP85-441和R570基因组参考序列的微卫星位点鉴定和SSR标记开发》

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对割手密单倍体35 519个基因的蛋白序列、甘蔗25 316个基因的蛋白序列进行比对，并分别与高粱基因的蛋白进行比对，分别鉴定出16 691个和13 271个对应到高粱1～10号染色体上的同源基因，其中有8854对割手密和甘蔗同源基因同时与高粱基因同源（图2，表3）。甘蔗、割手密和高粱同源基因在各染色体上不均匀分布，其中对应到高粱8号染色体上同源基因最少，推测甘蔗、割手密在进化过程中可能发生了基因丢失事件（图2）；其中栽培种甘蔗对应到高粱1～4号染色体上的同源基因最多，且这些基因在甘蔗参考基因组上的分布与其同源基因的分布一致性较高；割手密对应到高粱1、3、4号染色体上的同源基因最多，割手密2、5、6和7号染色体上的同源基因对应到高粱染色体4～9号染色体，可能与高粱向割手密进化过程中染色体的重排和丢失有关；甘蔗-高粱-割手密同时同源的基因也主要对应到高粱1～4号染色体。基因定位显示甘蔗基因组参考序列与高粱基因组的一致性更高（图2），且甘蔗与高粱同源基因大部分具有相同的染色体分布。