《表2 杨梅基因组测序的组装结果》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《杨梅分子生物学研究进展》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

Jia等[46]采用二代Illumina双末端测序结合三代PacBio测序进行杨梅雌株‘Y2012-145’、雄株‘H2011-12’两个品系的全基因组测序，结果显示（表2）：杨梅基因组大小为320 Mb，组装基因组大小313 Mb，占预测基因组大小的97%，预测出蛋白编码基因32 493个。雌性植株‘Y2012-145’，Illumina测序深度为278 X，PacBio测序深度为15 X；雄性植株‘H2011-12’，Illumina测序深度为48 X，PacBio测序深度为61 X；最后用HABOT软件组装，雌雄两个杨梅树的基因组都达到了313 Mb，覆盖了杨梅基因组（323 Mb）的96.9%。结合遗传图谱分析，锚定到染色体水平得到最终的雌雄个体基因组大小分别是280 Mb(90%）和264 Mb(84%），说明实验组装效果很好。杨梅利用传统育种手段进程缓慢，周期较长，杨梅全基因组测序结果的公布将有助于了解杨梅的基因组结构和功能，对探索杨梅的起源与进化、开展重要功能基因的定位和克隆、加速分子育种进程等都具有重要的指导意义。同时，杨梅的基因组序列可作为其他杨梅科植物基因组测序的参考，加快推动其他植物的遗传育种进程。