《表2 宏基因测序与组装信息》

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《宏基因组学探究原料乳冷藏过程菌群变化规律》


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注:N50(N90)指将各contigs序列按长度大小排序,从大至小逐一扫描各条序列的长度值,进行累加,当该累加值第一次超过所有序列总长度50%(90%)时,扫描到的序列长度值。A01、A02、A03、A11、A12、A13、A31、A32、A33表示原料乳冷藏2、24、72 h,下同。

本研究对3个时期(2,24,72h)的样本A0、A1、A3(n=3)共计9个样品进行了宏基因组测序,测序与组装信息见表2,结果显示平均每个样本产生了43 291 358个总长度为6.5×109 bp的原始序列,经过质控处理后,干净序列(clean reads)占原始序列的98%以上。拼接组装得到contigs数平均为1 003 897,通过基因预测,平均ORF序列数为398999。以上数据保证了结果的完整性与有效性。