《表1.宏基因组和单细胞测序在热泉中的典型应用实例》

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《分子生物学技术在热泉地质微生物学研究中的应用》

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最新的一系列研究已经证实单细胞基因组与宏基因组相结合可以大大提高基因组拼接的完整性和连续性[75]，在挖掘探索热泉生态系统中的微生物暗物质方面产生了实质性的进展（表1）。Dodsworth等[7]通过单细胞基因组数据和宏基因组数据分别从热泉沉积物和纤维素降解富集培养物中获得了OP9的近完整的基因组，建议将其命名为“Atribacteria”，并预测了其代谢特征；Fadrosh等[30]在2016年从在全球收集的5.2 Tbp宏基因组数据中发现了一种专门生存于高温中性热泉的新型细菌门“Candidatus Kryptonia”，并通过宏基因组数据结合单细胞基因组数据组装得到其中4个属的基因组；Yu[76]等开发了一种改进后的单细胞-宏基因组技术，该技术首先将细胞分组，每组含有5–10个细胞，然后对每组细胞进行宏基因组测序分析，这样在保证单细胞的高分辨率的同时可以尽可能覆盖样品的多样性，通过这种技术他们从美国黄石国家公园的热泉样品中获得了29个新的基因组。