《表3 基因组组装结果数据》
采用K-mer=41 bp对两个供试杜鹃品种进行Contigs和Scaffolds组装。在映山红与皋月杜鹃的基因组组装中,总共得到3 028 628与2 343 372条Contigs,它们的Contig总长度在899 138 404 bp和708 539 455 bp,最长的Contig分别达到73 263 bp和20 373 bp,其中,映山红最长的Contig序列长度为73 263 bp,N50长度为403 bp,皋月杜鹃最长的Contig序列长度为20 373 bp,N50长度为440 bp(表3)。利用这些序列对映山红和皋月杜鹃基因组进行进一步组装,分别得到1 756 842与1 169 525条Scaffolds,总长为1 084 Mb与880 Mb,对应最长的Scaffold长度分别为180 293 bp和65 412 bp,N50长度分别为1 623 bp和2 137 bp。
图表编号 | XD0059070500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.14 |
作者 | 周媛、资宏、童俊、董艳芳、毛静、徐冬云、方林川 |
绘制单位 | 武汉市农业科学院林业果树研究所湖北省园林植物工程技术研究中心、华中农业大学园艺林学学院、武汉市农业科学院林业果树研究所湖北省园林植物工程技术研究中心、武汉市农业科学院林业果树研究所湖北省园林植物工程技术研究中心、武汉市农业科学院林业果树研究所湖北省园林植物工程技术研究中心、武汉市农业科学院林业果树研究所湖北省园林植物工程技术研究中心、武汉市农业科学院林业果树研究所湖北省园林植物工程技术研究中心 |
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