《表2 6个小麦样品的组装质量统计》
使用Illumina/Solexa平台的HiSeqTM2000测序仪对6组样品转录组进行高通量测序,将含有接头的、重复的、质量低的片段除去,6组样品各得到52907600条、51175658条、55517344条、51214286条、54083574条、55398606条纯净片段(clean reads)。使用“Trinity”软件对纯净片段进行de novo拼接,将6组样品都含有的相同序列合并,共得到87291条Unigenes,总长度为75614264 bp,平均长度为866 bp,N50值为1344 bp(表2)。长度大于500 bp的有40724条,大于1000 bp的有22291条,其中5′→3′方向注释的Unigenes共60495条,表明样品转录组测序和拼接的质量较好。
图表编号 | XD0099426200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.16 |
作者 | 刘娜、乔妹、孙嘉伟、陈琰、侯春燕、韩胜芳、王冬梅 |
绘制单位 | 河北省植物生理与分子病理学重点实验室、河北农业大学生命科学学院、河北省植物生理与分子病理学重点实验室、河北农业大学生命科学学院、北京诺禾致源科技股份有限公司、河北省植物生理与分子病理学重点实验室、河北农业大学生命科学学院、河北省植物生理与分子病理学重点实验室、河北农业大学生命科学学院、河北省植物生理与分子病理学重点实验室、河北农业大学生命科学学院、河北省植物生理与分子病理学重点实验室、河北农业大学生命科学学院 |
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