《表2 辣椒SSR主要重复基序分布》

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《辣椒EST资源的SSR信息分析》


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检测出的辣椒EST-SSR共包含有650种基序类型,2~6核苷酸重复序列均存在,但频率差异较大,从4.9%~45.6%不等(图1)。在二核苷酸重复类型中检测出的16种基序类型以GA/TC和AG/CT为主,分别占全部基序的12.41%和10.56%(表2)。而在其他核苷酸重复类型中,则分别以其AGA/TCT(2.48%)和AAT/ATT(2.25%)、TAA/TTA(1.38%)、GAA/TTC(2.33%)、ATA/TAT(2.25%)、TCA/TGA(2.05%)、AAG/CTT(1.91%)、TAAT/ATTA(0.52%)、ATATA/TATAT(0.69%)、CAA CAC/GTGTTG(1.89%)、AACCAA/TTG GTT(1.76%)为主,说明随着重复数的增多,重复基数的频率分布越离散。