《表1 牡丹花色基因SSR重复类型的分布特征》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《基于RNA-seq牡丹SSR标记开发及通用性分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

对牡丹花瓣转录组功能注释的Unigenes信息进行搜索，得到278条涉及调控花色形成相关的Unigenes，总长229.41 kb。用SSRIT软件对这些序列进行搜索，得到215个SSR位点，分布在128条Unigenes上，发生频率为46.04%，平均每1.07 kb出现1个SSR标记。在128条Unigenes序列中，含有1个SSR位点的Unigenes 72条（56.25%），含有2个位点的有38条（29.69%），含有3个及以上的有18条（14.06%）。在所搜索到的215个位点中，三核苷酸重复（90个，41.86%）是最多的类型，其次是六核苷酸重复（78个，36.28%），和二核苷酸重复（40个，18.60%），四、五核苷酸重复是最少的（表1）。SSR重复基元的重复次数范围为2～5次，其中有77个SSR位点是2次重复的，占总个数的35.81%；3次重复的有88个，占40.93%；4次重复以上的有50个，占23.26%。本结果表明，三核苷酸重复在牡丹EST-SSR中是占主导地位的。