《表1 黄麻SSR的分布特征》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《黄麻全基因组SSR鉴定与特征分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

I类SSR指重复序列长度大于20 bp，而II类SSR指重复序列长度大于12 bp且小于20 bp。SSRs of class I mean repeat length≥20 bp，SSRs of class II mean repeat length≥12 bp and<20 bp.

分析了黄麻重复基元为2~6 bp，且重复长度不短于12 bp的SSR分类和分布情况，如表1所示。黄麻全基因组大小为338 Mb，共开发了153，242个完整的SSR，平均密度为467.20个SSR Mb–1。其中，I类（重复序列长度≥20 bp）SSR有38，917个（25.40%），平均密度为118.65个SSRs Mb–1；而II类（重复序列长度≥12 bp和<20 bp）SSR有114，325（74.60%），平均密度为348.55个SSR Mb–1。黄麻所有基因的cDNA大小为41.20 Mb，共开发了10，747个SSR，平均密度为260.85 SSR Mb–1，包括1251个（11.64%）I类SSR和9496（88.36%）II类SSR，其平均密度分别为30.36个SSR Mb–1和230.49个SSR Mb–1。