《表1 金钱鱼基因组SSR中重复碱基优势类别》

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《金钱鱼基因组微卫星分布特征分析及多态性标记开发》


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单碱基重复类型中,A/T类别占绝对优势。A/T碱基微卫星重复数共125 988个,占单碱基总数的89.31%;C/G碱基微卫星重复数共150 77个,占单碱基总数的10.69%;二碱基重复类型中,AC/GT碱基微卫星重复数最多,为155 982个,占二碱基总数目的75.80%,其次是AG/CT(17.86%)和AT/AT(6.27%);三碱重复类型中,AGG/CCT碱基微卫星重复数最多,为8 104个,占三碱基总数的25.95%,其次是AAT/ATT(22.78%)和AAG/CTT(13.79%);四碱基重复类型中,AGAT/ATCT碱基微卫星重复数最多,为2 112个,占四碱基总数的20.37%,其次是AAAT/ATTT(13.96%)和ACAG/CTGT(12.66%);五碱基重复类型中,AGAGG/CCTCT碱基微卫星重复数最多,为317个,占五碱基总数的15.17%,其次是AAAAC/GTTTT(9.67%)和AAGAG/CTCTT(8.90%);六碱基重复类型中,AATCAG/ATTCTG碱基微卫星重复数最多,为161个,占六碱基总数的37.79%,其次是AACCCT/AGGGTT(8.22%)和AAGAGG/CCTCTT(2.35%)(表1)。