《表2 沟渠豹蛛转录组中不同SSR序列的出现情况》

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《基于转录组的沟渠豹蛛SSR信息分析》

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在单核苷酸重复基元中，A/T （7 409个）出现频率最高，属于单碱基的优势重复单元，占单核苷酸重复基元SSR总数的95.21%，其次是C/G （373个；占4.79%）。在所有1～6核苷酸重复基元中A/T也是比例最大的SSR，占总SSR的69.19%。在二核苷酸重复基元中，AT/AT （1 518个）出现频率最高，为二核苷酸SSR优势重复单元，占二核苷酸重复基元SSR总数的69.70%，其次是AC/GT （156个；占11.75%）、CA/TG （163个；占7.48%）、AG/CT （146个；占6.70%）、CT/AG （92个；占4.22%）、CG/CG （3个；占0.14%）。在三核苷酸重复基元中，AAT/ATT （108个）出现频率最高，占三核苷酸重复基元SSR总数的15.93%，属于三碱基中的优势重复基元，其次是ATT/AAT（68个；占10.03%）、ATA/TAT （48个；占7.08%）、AAC/GTT （31个；占4.57%）。在四核苷酸重复基元中，AAAT/ATTT （14个）出现频率最高，占四核苷酸重复基元的21.54%，其次是AATA/TATT （7个；占10.77%）、ATAA/TTAT （6个；占9.23%），其他重复基元的出现频率较低。在五核苷酸和六核苷酸中，各个重复基元的个数都为1，出现频率都很低，均为1%（表2）。单核苷酸的重复基元类型虽少，但数量是这几种核苷酸中最多的；三核苷酸的重复基元类型最多，但数量远远少于单核苷酸。