《表4 一串红基因组SSR数据库的部分结果Tab.4 Part of the Salvia splendens genomic SSR database》

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《一串红全基因组调研及SSR特征分析》


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对一串红基因组中1~6核苷酸重复完整型和复合型SSR进行查找分析。从当前组装的一串红基因组中查找的序列总长度为438 155 920bp(有效读长),总序列数为142 300个,其中58 525个序列中共查找到95 982个SSR位点,平均每4 565bp出现1个SSR,其中有22 807个序列包含的SSR位点数大于等于2个。95 982个SSR位点中复合型的SSR为13 281个。其中部分微卫星信息见表4。