《表4 SSR-PCR筛选引物详细情况Table 4 The details of SSR-PCR primers selected》

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《两种黄连转录组中SSR位点信息分析与多态性引物开发》

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筛选出适合扩增的位点不重复的1 676对引物，先合成60对作为初筛引物，选取差异性大的样品8个，分别是HL01、HL02、HL03、HL04、HL05、HL06、HL07、HL08。用选取的不同引物进行扩增，将扩增好的PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳，根据凝胶图，确定目的DNA片段扩增，而后选取了34对扩增条带较好的引物准备二次扩增。用带荧光的接头引物和正向引物对一次扩增的产物进行二次扩增，扩增体系及条件与一次相同，用软件Gene mapper 4.1进行数据准确位点的分析，分析数据按照引物对应关系的核心碱基重复数来确定位点准确大小。根据分析出来的位点信息来判断检测引物是否具有位点多态性，选取特异性高，多态性好的位点作为后续研究的重点。最终，筛选出了12对引物（表3；表4），表现出多态性差异，多态性信息量（PIC）范围为0.30~0.72，平均值为0.56。