《表3 Unigene长度分布统计》

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《基于转录组测序初步揭示天麻生长代谢的分子机制》


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对片段进行拼接得到72 244个Unigene转录物。组装结果质量评估可从N50数值来评估。将所有Unigene从长到短排序,并依次累加长度。当累加片段长度达到总片段长度(所有Unigene的长度)的50%时,对应那个片段的长度和数量,即为Unigene N50长度和数量。Unigene N50越长,数量越少,说明组装质量越好。在本实验中,由组装结果得N50长度为1733 bp,其中Unigene序列最长为15 844 bp,最短为201 bp,平均长度为916 bp,长度在1000 bp以上的Unigene有18 698个,占总数的25.88%(表3)。