《表2 6个茶叶样品Unigene基因长度分布》

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《基于转录组测序的茶树儿茶素合成调控相关基因的挖掘》


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随后,使用Trinity软件对来自6个文库的clean reads进行De novo拼接组装,共获得112 233个Unigene,序列总长度为85 1 74 060 bp,平均长度为759 bp,N50长度为1 081 bp(表2),表明组装完整性较好。对获得的基因片段长度进行统计,发现长度在201~600 bp的数量最多为69 544条,占总体的61.96%,长度在601~1 000 bp的数量为20 167条,占总体的17.97%,长度在1 000~2 000 bp的数量为14 452条,占总体的12.88%,长度大于2 000 bp的有8 070条,占总体的7.19%。