《表2 25个多花黄精样品的ITS2和psbA-trnH序列长度和碱基分布频率》

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《基于DNA条形码的多花黄精系统发育和变异位点分析研究》

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本研究分别扩增了25份多花黄精资源的ITS序列和psbA-trnH区段DNA序列。ITS2序列包括部分5.8 S rRNA序列+ITS2序列+部分28 S rRNA序列，psbA-trnH序列包括psbA基因全长+psbA-trnH间区全长+trnH基因全长。参照KX375075和KJ745884序列提取25个样品的ITS2和psbA-trnH序列后进行分析，安徽青阳样品的ITS2序列和psbA-trnH序列分别为224 bp和620bp，其余24个样品的ITS2序列和psb A-trn H序列分别为225 bp和621 bp。这些样品的ITS2序列和psbA-trnH序列在G+C含量方面较为接近（表2）。以滇黄精ITS2序列和psb A-trn H序列为外群，用邻接法基于ITS2序列和psb A-trn H序列构建系统发育树（图1）。结果显示，ITS2序列可将25份多花黄精资源分为2个大的类群，其中来自湖南洪江、新宁和资兴的样品和来自贵州花溪、剑河的样品组成一个类群，其中贵州剑河和花溪的样品又组成一个小的类群；其余20份资源组成另一个大的类群，其中湖北通山、雅安和麻城的样品组成一个小的类群，安徽青阳和浙江遂昌的样品组成一个小的类群，其余的来自福建、江西和广东的15个样品则无法区分开，基于ITS2序列构建的系统树显示出多花黄精资源具有地理遗传多样性。基于psb A-trn H序列构建的系统发育树则无法将25个样品区分开，但来自贵州剑河、福建泰宁和福建建阳的样品同其他22个样品具有一定差异。相对psbA-trnH序列，ITS2序列构建的系统发育树对不同地域来源的多花黄精样品区分度更好。