《表2 两两样品间SNP-Unigene数量统计表》
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《拟环纹豹蛛响应温度胁迫SNP位点挖掘及其功能注释分析》
使用软件SOAPsnp对转录组数据分析发现,3个转录组文库中总共存在402 910个SNP位点,其中低温处理组(TL)各基因型共存在220 235个SNP位点,高温处理组(TH)各基因型存在182 675个SNP位点(表1)。获得的67 725条Unigene中共存在7 421条SNP-Unigenes,其中低温处理组各基因型共存在6 360条SNP-Unigenes,高温处理组各基因型共存在5 469条SNP-Unigenes(表2)。SNP-Unigenes总长度为12 124 783 bp,编码区长度为7 100 355 bp,非编码区长度占5 024 428 bp,SNP发生频率为1/301 bp。两组间各基因型发生转换和颠换的情况见图1,空白组和低温处理组或高温处理组都是杂合基因型时发生转换和颠换的SNP-Unigene最多(图1)。
图表编号 | XD00118382000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.28 |
作者 | 王祥银、孙良玉、刘靖、肖榕 |
绘制单位 | 贵州大学农学院贵州省山地农业病虫害重点实验室、贵州大学农学院贵州省山地农业病虫害重点实验室、贵州大学农学院贵州省山地农业病虫害重点实验室、贵州大学农学院贵州省山地农业病虫害重点实验室 |
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