《表1 翘嘴鳜转录组序列特征》

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《翘嘴鳜转录组测序及SSR新标记的开发与应用》


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注:N50,排序后将Unigenes按序依次相加;当相加的长度达到总长度的一半时,最后一个加上的Unigene长度

通过转录组测序及数据过滤,共获得41533736条高质量Reads,近6.16 G数据量,GC含量50.05%,Q20值为96.64%。利用Trinity(Grabherr et al.,2011)进行de novo组装,共得到7 715 008条重叠群(Contig),平均长度为57.57 bp,N50长度为48 bp。对这些Contig进一步组装,得到N50长度为1 843 bp,平均长度为888.94 bp的138 728条Unigenes(表1)。