《表5 翘嘴鳜23个多态性SSR位点的遗传参数》

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《翘嘴鳜转录组测序及SSR新标记的开发与应用》

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注:Na:等位数；Ne:有效等位数；Ho:观测杂合度；He:期望杂合度；I:香浓指数；PIC:多态信息含量

使用Primer5.0软件对转录组SSR进行引物设计，每条SSR序列产生5对引物。随机选取其中二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸重复基元类型的80条SSR序列进行引物合成和PCR扩增，对SSR的有效性进行筛选。结果表明，80对SSR引物扩增中，39对无扩增产物或产生多条非特异性弱带，41对（51.25%）SSR引物得到预期产物大小的有效扩增。利用毛细管电泳仪Qsep100 DNA Analyzer（BiOptic，China）对这41个有效SSR引进行多态性筛选，发现其中23个SSR位点在24尾翘嘴鳜检测样品中呈现丰富的多态性（图2）。23个多态性SSR位点信息（表4），使用Popgene v1.32（Yeh et al.，1999）分析其遗传参数。结果显示，23个多态性位点的等位基因数（Na）从2至10不等，观测杂合度（Ho）和期望杂合度（He）分别为0～1和0.198～0.888，而各个位点的多态信息含量（PIC）为0.175～0.857（表5）。