《表6 109个无性系样品在12个EST-SSR位点的遗传多样性参数》

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《两种标记方法对短枝木麻黄(Casuarina equisetifolia)无性系遗传多样性评价的差异分析》

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12对EST-SSR引物对109个短枝木麻黄无性系单株进行扩增（表6），共检测到50个等位基因，每个位点3～6个，总的扩增片段范围在129～292 bp，PPB均为100%。多态信息含量（PIC）体现了引物扩增位点的多态性高低，PIC值越大表明该位点的多态性越高。各位点的多态信息含量PIC在0.35～0.72，平均为0.58。根据引物多态性信息量的评价标准（高:PIC>0.5；中:0.5>PIC>0.25；低:PIC<0.25）（Botstein et al.，1980），说明此12个SSR位点的多态性总体较高，使用价值较大。观测杂合度（Ho）和期望杂合度（He）反映群体内某一基因座上的等位基因是杂合体的频率，其中Ho值越大表明杂合体的比例越高。本研究中，Ho和He的变化范围分别在0.23～1.00、0.39～0.76。不同位点获得的Shannon多样性指数I的变化范围为0.70～1.53，表明不同位点对短枝木麻黄的基因多样性作用有所不同；无效等位基因频率R，负值意味着观测到的杂合子基因型过多。对于无效等位基因频率有较大的正估计值的位点表示纯合子数量过多，本研究12个位点中除C13外，其余位点的R值均小于0.20，且均为负值，说明EST-SSR引物的稳定性较好。