《表1 棒瑚菌测序转录组的数据质量统计》
注:CP-1a,CP-1b,CP-1c是幼菇期(CP-1)的3个重复样品;CP-2a,CP-2b,CP-2c是成熟期(CP-2)的3个重复样品
CP-1与CP-2进行RNA-Seq测序后分别获得原始数据(Raw reads),去除带接头的reads和低质量的reads后分别获得8.78 G(CP-1)和8.28 G(CP-2)分析数据(Clean reads)。综合3次测序结果的平均值,其中CP-1的Q20(%)为97.60%,Q30(%)为94.12%,GC含量为57.75%,CP-2的Q20(%)为97.65%,Q30(%)为94.03%,GC含量为57.70%,碱基错误率均为0.01%。拼接分析数据Clean reads后一共获得151 367个转录本(Transcript),101 291个不同长度的非重复独立基因Unigene,占总转录本的66.92%。以上结果说明该测序结果可靠性较高,可用于下一步分析研究(表1,图1)。
图表编号 | XD00106188800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.26 |
作者 | 唐贤、丁祥、董明明、朱淼、宋志强、侯怡铃 |
绘制单位 | 西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室、西华师范大学环境科学与工程学院、西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室、西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室、西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室、西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室 |
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