《表1 棒瑚菌测序转录组的数据质量统计》

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《棒瑚菌子实体不同发育时期的转录组分析》


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注:CP-1a,CP-1b,CP-1c是幼菇期(CP-1)的3个重复样品;CP-2a,CP-2b,CP-2c是成熟期(CP-2)的3个重复样品

CP-1与CP-2进行RNA-Seq测序后分别获得原始数据(Raw reads),去除带接头的reads和低质量的reads后分别获得8.78 G(CP-1)和8.28 G(CP-2)分析数据(Clean reads)。综合3次测序结果的平均值,其中CP-1的Q20(%)为97.60%,Q30(%)为94.12%,GC含量为57.75%,CP-2的Q20(%)为97.65%,Q30(%)为94.03%,GC含量为57.70%,碱基错误率均为0.01%。拼接分析数据Clean reads后一共获得151 367个转录本(Transcript),101 291个不同长度的非重复独立基因Unigene,占总转录本的66.92%。以上结果说明该测序结果可靠性较高,可用于下一步分析研究(表1,图1)。