《表1 烟草甲转录组的测序结果》

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《烟草甲对不同波长光源的趋性及视蛋白序列分析》

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烟草甲的转录组测序结果见表1。在烟草甲中共获得总计6.49 Gb的数据。组装并去冗余后得到26 761条Unigene，总长度、平均长度、N50以及GC含量分别为36 659 980 bp、1 369 bp、2 376bp和43.57%。将Unigene比对到功能数据库进行注释，最终分别有18 947(NR:70.80%）、6 007(NT:22.45%）、15 000(Swiss Prot:56.05%）、14 467(KOG:54.06%）、15 336(KEGG:57.31%）、10 256(GO:38.32%）以及15 688(Inter Pro:58.62%）个Unigene获得功能注释。使用Transdecoder检测出21 222个CDS。同时还检测出2 561个SSR分布于1 994个Unigene中，同时预测出2 915个编码转录因子的Unigene。表明测序质量较好，数据具有可靠性。