《表1 测序质量评估:基于高通量测序的柚木边材转录组分析》

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《基于高通量测序的柚木边材转录组分析》


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对6个柚木边材样品进行高通量测序分析,共检测到432.86 Mb Raw Reads序列,Q20碱基百分比≥98.34%,Q30碱基百分比≥94.78%(表1)。组装共获得90 843个Unigenes序列,平均长度1 415 bp,N50长度为2 208 bp,N90长度为708 bp,GC含量为41.28%。Unigene长度分布统计发现,长度在500 bp以下的序列有26 848个,占序列总数的29.55%;长度在1 000~2 000 bp的序列有24 348个,占总数的26.80%;长度大于2 000 bp的序列有23 219个,占总数的25.56%;统计长度在1 000 bp以上的序列共计47 567个,占序列总数的52.36%(表2)。