《表1 测序结果信息：基于高通量测序技术分析3种羊肉混合基因组序列的短片段重复序列》

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《基于高通量测序技术分析3种羊肉混合基因组序列的短片段重复序列》

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对3种绵羊肉品混合样本进行宏基因组物种多样性分析，如表1获得6.1 GB有效序列，42 211 072条序列，该结果与单一品种绵羊测序结果5.0 GB相比较大，表明该测序结果涵盖滩羊、小尾寒羊、滩寒杂交羊的部分基因。该测序结果中序列长度平均长度150 bp，GC含量45.67%。使用Blast+，随机从通过QC(Quality control，即质量控制/质控）的2 147 483条有效序列中抽取1000条序列进行BLAST比对，比对数据库为NCBI NT数据库，取evalue≤1×10-1并且相似度>90%，coverage>80%的比对结果，计算其物种分布。划分为45个类别，典型类别如图1所示。根据种属划分和分类地位鉴定结果，可以获得样本在各分类水平的具体组成。使用NCBI选取的绵羊属动物的序列与样本中所有序列进行对比分析发现，1000条序列并非可以与NCBI数据库中序列一一对应，只有部分可以归属到对应种属中，其中有118条序列为绵羊属序列，包括大角羊、白大角羊、西藏盘羊、盘羊、小尾寒羊等。绵羊属序列占有效序列总含量数目远大于微生物序列，可以看出绵羊属动物平均丰度最大，属于优势类群，而其它源性遗传物质未被发现大面积存在。