《表1 不同组织样品高通量测序数据评估统计》

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《基于RNA-seq技术的江鳕不同组织转录组比较分析》

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Q30：质量值≥30的碱基所占百分比

经过测序质量控制，共得到20.78 Gb的clean data，过滤后的碱基分布比较稳定，平均GC含量为53.16%，各组织样品Q30碱基百分比均不小于87.91%（表1）。将过滤后的reads片段进行聚类及拼接组装，共得到175 804条转录本（transcript）和106 084条unigenes，transcript与unigenes的N50（重叠群序列累加后长度超过转录组总长度一半时的重叠群序列长度）分别为2 285和1 254，组装完整性较高（图1）。其中长度在200～300 bp之间的unigenes数量最多，为42 058条，约占总unigenes数量的39.65%；长度>2 000 bp的数量最少，有7 975条，约占总数的7.52%。Transcript长度为200～300bp的数量最多，有48 087条，占总体的27.35%；长度为1 000～2 000 bp的数量最少，为29 251条，占总数的16.64%；长度300～500 bp、500～1 000 bp和>2000 bp的占比数量大致相当，分别为19.95%、18.02%和18.04%。这些Transcript和unigenes的组装为下一步进行功能注释和表达量研究提供了基础信息。