《表1 高通量测序数据质量控制统计》

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《表1 高通量测序数据质量控制统计》
Q20、Q30分别代表Phred数值大于20、30的碱基占总体碱基的百分比,表示的碱基正确识别率为99.0%和99.9%。
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Illumina Nova Seq 6000高通量测序得到的原始图像数据文件经CASAVA碱基识别(base calling)分析转化为原始测序序列(raw bases)。对获得的原始测序数据进行质量控制,过滤掉带接头(adapter)的读序、单端测序读序中N数量超过此读序长度比例10%的读序、及单端测序读序中含有的低质量(Q≤5)碱基数超过该条读序长度比例50%的等低质量读序,获得Clean Bases和Clean Reads。本研究获得样品的原始测序量为41.16~47.13 G,有效读序为274,371,776~314,171,200,Q30大于90%,说明获得的测序数据丰富可靠(表1)。

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