《表1 高通量测序数据质量控制统计》

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《基因组测序技术解析耐除草剂转基因水稻G2-7的分子特征》

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Q20、Q30分别代表Phred数值大于20、30的碱基占总体碱基的百分比，表示的碱基正确识别率为99.0%和99.9%。

Illumina Nova Seq 6000高通量测序得到的原始图像数据文件经CASAVA碱基识别（base calling）分析转化为原始测序序列（raw bases）。对获得的原始测序数据进行质量控制，过滤掉带接头（adapter）的读序、单端测序读序中N数量超过此读序长度比例10%的读序、及单端测序读序中含有的低质量（Q≤5）碱基数超过该条读序长度比例50%的等低质量读序，获得Clean Bases和Clean Reads。本研究获得样品的原始测序量为41.16～47.13 G，有效读序为274，371，776～314，171，200，Q30大于90%，说明获得的测序数据丰富可靠（表1）。