《表1 测序数据评估统计:基于Illumina HiSeq 2500测序技术对高温胁迫下苦瓜叶片转录组特性分析》

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《基于Illumina HiSeq 2500测序技术对高温胁迫下苦瓜叶片转录组特性分析》


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注:≥Q30%:质量值逸30的碱基所占的百分比Note:≥Q30%:The proportion of the reads quality value greater than or equal to 30

采用Illumiana HiSeq 2500测序技术对苦瓜高温胁迫前后叶片进行转录组测序,获得1.77 Gb Clean Data,Q30(错误率0.1%)碱基百分比在91.00%及以上。对Clean Data用Trinity组装后共获得89 757条Unigene,Unigene的平均长度为700.75 bp,N50为1 239 bp(表1)。其中长度在1 kb以上的Unigene有16 329条。大部分Unigene序列长度分布在200~300 bp,Unigene数量随着序列长度的增加而递减,在500~1 000 bp集中有42.64%的Unigene,大于1 000 bp的Unigene达到18.2%。这些结果均表明转录组测序和组装质量良好,能够满足后续开展基因功能分析要求(表2)。