《表2 有效数据统计：应用Illumina MiSeq高通量测序技术分析堇叶碎米荠根际土壤微生物多样性》

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《应用Illumina MiSeq高通量测序技术分析堇叶碎米荠根际土壤微生物多样性》

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注：AvgLen为Clean Tags的平均长度；Effective为No.of seqs在Clean Tags中的占比

对测序结果进行图像识别（Base calling），获取测定序列及质量值，对各样本数据量及测序质量进行初步统计分析，并对原始数据进行预处理，对低质量数据进行过滤，去除嵌合体、singleton OTU（只有1条代表序列的OTU）、污染OTU（叶绿体、线粒体以及不能注释到界级别的OTU）及接头序列，优化后数据量及质量统计见表2，得到有效Tags序列数。从表2可以看出，9个样本的最终有效Tags总共有124 798 bp序列被测出，每个样本平均13 866 bp。