《表2 高通量测序技术在白酒糟醅微生物多样性研究中的应用》

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《白酒糟醅微生物多样性的研究进展》

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高通量测序技术，又称“第二代”测序技术，是现今应用最广泛的测序技术，该技术能一次并行测定几十万到几百万条DNA分子序列，且一般读长较短，能够深入、细致全貌的分析一个物种的转录组和基因组。2005年，454 Life Science公司首先推出了基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统，开创了第二代测序技术的先河，但由于其通量低、成本高等缺点，目前已退出市场。随着对测序技术的改进，Illumina公司与ABI公司相继推出了Solexa和SOLID测序技术占据主流地位[63-64]。近年来，高通量测序技术被广泛应用于发酵食品菌群多样性研究[65-66]，同时，越来越多的研究者将这一技术应用于白酒酿造过程中微生物多样性的研究。Wang等[67]采用16S r RNA扩增子测序技术分析了糟醅、窖泥和大曲中的原核生物群落，结果表明，大曲中微生物对糟醅发酵的影响主要表现为发酵前期，窖泥中微生物对发酵糟醅的作用存在于整个发酵过程中；大曲、糟醅及窖泥中共鉴定出299个属，以乳酸菌属（Lactobacillus）、白串珠菌属（Leuconostoc）、葡萄球菌属（Staphylococcus）、葡萄糖杆菌属（Gluconobacter）、醋酸杆菌属（Acetobacter）、石化菌属（Petrimonas）、梭菌属（Clostridium）、瘤胃球菌属（Ruminococcus）、甲烷菌属（Methanobacterium）和甲烷杆菌属（Methanobrevibacter）10个属为主。Huang等[68]采用454焦磷酸测序技术对浓香型白酒和酱香型白酒发酵过程中细菌与真菌微生物多样性、功能进行综合分析，分别从酱香型中鉴定出细菌315属、真菌72属，从浓香型中鉴定出细菌83属、真菌47属；使用PICRUSt软件对发酵过程中细菌群落功能进行预测，选择丰度前50的代谢通路进行分析，预测结果显示，浓香型白酒糟醅与酱香型白酒糟醅在能量、碳水化合物、氨基酸的代谢通路上具有明显差异。表2列举了部分高通量测序技术在白酒糟醅微生物多样性研究中的应用。