《表3 测序数据评估统计:基于Illumina HiSeq 2500测序技术对高温胁迫下苦瓜叶片转录组特性分析》

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《基于Illumina HiSeq 2500测序技术对高温胁迫下苦瓜叶片转录组特性分析》


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使用BLAST软件将Unigene序列与NR、SwissProt等数据平台比对,以获得Unigene对应的蛋白功能注释信息。结果显示,共有48 662条Unigene.获得注释信息,在设定的E值范围最终有48 662个有注释信息的Unigene,占全部Unigenes的54.2%(表3)。其中,Nr数据库注释到信息最多,注释了45 889条Unigene,其次是Pfam_Annotation、Swissprot的功能注释。使用DBSeq进行差异表达分析,高温胁迫后差异表达基因有2 254个,上调、下调的基因数分别为672个和1 582个。