《表1 3种碳源条件下Foc转录组预测的次生代谢物合成基因簇》

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《3种碳源条件下香蕉枯萎病菌次生代谢物合成基因的表达谱分析》

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本研究以不同的寄主细胞壁多糖条件下Foc 1和Foc 4的转录组数据进行SMB基因分析，通过antiSMASH数据库的注释，共预测到486个unigene。其中，83个unigene被预测为SMC的主要合成基因，并分类到32个SMC中（表1）。32个SMC包括3个T1pks基因簇，1个T3pks基因簇，9个Nrps基因簇，1个Nrps-T1pks基因簇，10个Terpene基因簇，3个Indole基因簇和5个其他基因簇。根据上述SMB基因分析推测，3种碳源条件下Foc主要次生代谢物类型为I型聚酮、III型聚酮、T1pks-nrps聚酮、萜类和吲哚类。