《表1.白骨壤链霉菌9-9基因组中次级代谢生物合成基因簇的预测》

《表1.白骨壤链霉菌9-9基因组中次级代谢生物合成基因簇的预测》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《红树林源白骨壤链霉菌中多环稠合大环内酰胺类化合物的结构多样性研究》


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我们将白骨壤链霉菌中的PTMs基因簇与链霉菌ZJ306及厦门链霉菌318中已经证实的ika基因簇进行比较发现:白骨壤链霉菌中存在的avi A–D与PTMs类化合物的生物合成基因簇ika A–D是一一对应的。其特点在于,从基因排列上来看,白骨壤链霉菌中aviD基因位于aviC的直接下游,而在另两种链霉菌ZJ306及厦门链霉菌318中,ikaC和ikaD被多个不相关基因隔开。进一步对aviA–D分别进行BLASTP分析发现,这4个蛋白与IkaA–D均具有较高的序列相似性,相似性值从53%到75%不等,覆盖率为99%–100%(表2)。因此,白骨壤链霉菌9-9具有产生PTMs类化合物的潜能。