《表1 Rhizobacter gummiphilus NBRC 109400次级代谢产物合成基因簇预测》

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《一株橡胶降解菌Rhizobacter gummiphilus NBRC 109400的全基因组测序及功能挖掘》

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该菌株共预测得到了9个基因簇，其中PKS/NRPS基因簇有2个（表1），表明NBRC 109400菌株具有合成多种生物活性物质的能力。其中2号基因簇（表1）与菌株Delftia acidovorans SPH-1中的delftibactin基因簇（NCBI登录号为CP000884，Daci＿4753～Daci＿4759）具有71%的序列相似性。delftibactin基因簇可以产生次级代谢产物delftibactin A，可以将可溶性金离子转化为胶体金（Johnston et al.，2013）。本研究中，按照Johnston等（2013）的方法将NBRC 109400菌株在适宜条件下培养3 d后使用含10μmol的Au Cl3的琼脂糖覆盖培养2 h，未能发现菌株NBRC109400周围有黑色环状物生成（图片未显示），推测该菌株不具有将可溶性金离子转化为胶体金的能力。通过比对分析2号基因簇和delftibactin基因簇发现，2号基因簇的CPZ87＿10740基因与delftibactin基因簇的Daci＿4754基因序列长度差异较大，同源性为60%，匹配长度为880 aa（图1），而Daci＿4754是NRPS基因，是影响D.acidovorans菌株金生物矿化特性的关键基因（Johnston et al.，2013），这间接证明了Daci＿4754基因对于D.acidovorans菌株的金生物矿化特性的重要影响。