《表2 Pantoea rodasii S1536次级代谢基因簇分析》

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《耐草甘膦菌株Pantoea rodasii S1536全基因组测序及比较基因组分析》

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次级代谢产物是以初级代谢产物为前体合成的小分子物质，对微生物的生命活动无明确功能，也不是生长繁殖所必需的物质。次级代谢基因簇在放线菌及真菌中被大量发现（表2），在泛菌属中也有存在。本研究使用antiSMASH-2.0.2程序对Pantoea rodasii S1536菌株的次级代谢产物合成基因簇进行预测，共预测到4个基因簇，包含1个thiopeptide类、1个hserlactone-arylpolyene类、1个nrps类和1个terpene-nrps类，其中thiopeptide类基因簇有19个基因，hserlactone-arylpolyene类基因簇有73个基因，nrps类基因簇有52个基因，terpene-nrps类基因簇有73个基因。其中，Cluster 1与Pantoea sp.YR343PMI39位于contig 50.50的基因簇相似性为100%。结果表明Pantoea rodasii S1536次级代谢基因簇不包含PKS基因簇，不具有产生抗感染、抗真菌、抗肿瘤、免疫抑制等活性的天然产物。